無菌性腦炎或者稱為腦膜炎是細菌沒有進到腦內，這時出現腦炎的表現是因為全身感染。比如肺部感染、消化道感染時細菌進入到血液裡造成菌血症，有部分人可能會到腦內造成腦內細菌感染。有部分人其它部位感染，但是細菌沒有到達腦部，是因為有高熱即稱為中毒症狀，以上會產生毒素，毒素經過血液運行到顱腦，進而刺激腦膜，影響腦膜會出現頭痛，甚至嘔吐，檢查時候可能會發現患者有腦膜刺激徵，類似有菌感染狀況，但是往往這種患者做腦脊液檢查時候，不會出現細胞數增高，也可能只是出現輕度蛋白增高。