植物神經紊亂提示器質性疾病，造成的植物神經功能紊亂，主要是影響到植物神經的各種原因，包括藥物中毒或者食物中毒，或者缺乏某些食物代謝性因素、自身免疫性因素、感染性因素等等，都會引起植物神經的功能紊亂。需要通過相關的檢查，如血液血檢查、血壓監測和影像學檢查腰椎脊髓，以及腦子的影像學檢查，來排除器質性原因。

如果確定存在神經病變的植物神經，需要給予針對性治療。如直立性的低血壓，也可以通過排汗的反射來進行測定，有沒有存在泌汗功能障礙，這些都是植物神經支配。一般如果是自身免疫性，需要給予免疫球蛋白治療、血漿置換治療改善症狀。還有一部分患者，是功能性，通過這些檢查以後，未見異常，但是存在植物神經功能平衡失調的症狀，失眠、神經衰弱、軀體化障礙等，給予對應的功能治療，來改善症狀。