植物神經紊亂時，中醫和西醫治療效果都較好，只是兩者之間有不同的理論體系、製藥方式和藥物，雖然都進行治病救人，但不同疾病有不同治療方法。如進行植物神經功能紊亂治療時，需判斷不同的證候類型，部分患者是失眠引起，部分是心煩、排汗異常、腹部不適，或皮膚溫度、顏色的變化引起，需根據具體病因進行治療。

西醫能營養神經，對於具有焦慮或抑鬱的情緒的人群，可以選擇抗焦慮、抗抑鬱治療，能改善植物神經功能紊亂。中醫雖然是對症、對因、對病治療，但治療因時、因人、因症而異，中醫的治療手段較豐富。如治療排汗異常，中醫既能益氣斂汗，也能對陰虛盜汗的症狀進行調節，同時也能改善失眠、驚悸、怔忪、心煩等症狀。