小腦功能是管運動協調，所以小腦萎縮會出現共濟失調、行走不穩，嚴重時病人連坐都坐不穩，只能臥床，而且還會出現意向性震顫，如要喝水，越到嘴邊兒時越震顫厲害。用餐具、吃飯、飲水都會出現出現困難。由於小腦萎縮往往是疾病表現，如神經系統變性病等引起，這些病人如多系統萎縮的病人，往往還會有明顯自主神經的功能障礙，病人會出現尿失禁、陽痿等症狀。

到後期小腦萎縮特別嚴重，伴隨著其它症狀，還可能會出現不自主運動。還有病人到了晚期還會出現痴呆，由於這些情況會導致病情惡化甚至死亡。