偏頭痛在急性發作期較嚴重時可使用麥角胺咖啡因、曲坦類藥物止痛，平常可使用鈣離子阻滯劑如氟桂利嗪，可有效控制和預防偏頭痛發作。此外，還有β受體阻滯劑如普萘洛爾等，也可預防偏頭痛發作。抗癲癇藥物如丙戊酸鈉等，以及三環類抑鬱藥，還有5-羥色胺再攝取抑制劑如舍曲林、氟西汀、帕羅西汀、西酞普蘭等，都可有效預防和改善偏頭痛發作。

神經痛若是由病毒感染引起，常用藥物有加巴噴丁、普瑞巴林、卡馬西平、奧卡西平等，可有效改善病毒感染引起的神經痛症狀。還需給予抗病毒治療，特別是由帶狀皰疹病毒引起的神經痛，需應用阿昔洛韋、泛昔洛韋、更昔洛韋等藥物。此外，再給予營養神經的藥物如甲鈷胺、維生素B1等，可有效改善神經痛和偏頭痛的症狀。