為什麼要進行造血幹細胞移植，造血幹細胞移植的主要目的是治療血液系統疾病。以下幾類疾病可通過造血幹細胞移植進行治療：

1、重型再生障礙性貧血：血液系統非惡性疾病最常見的是再生障礙性貧血，對於重型再生障礙性貧血，藥物治療無效，需要進行異基因造血幹細胞移植；

2、地中海貧血：還有華南地區常見的地中海貧血，也屬於基因異常疾病。目前只有通過異基因造血幹細胞移植才能治癒；

3、骨髓增生異常綜合徵、急性白血病：目前許多血液系統惡性疾病，比如絕大多數的急性白血病、骨髓增生異常綜合徵尚缺乏根治性的藥物，唯一根治的方法是進行異基因造血幹細胞移植；

4、淋巴瘤、骨髓瘤：其他有慢性粒細胞白血病、慢性淋巴細胞白血病，部分可以通過靶向藥物治癒，但是少數藥物治療無效的患者也要進行異基因造血幹細胞移植，像淋巴瘤、骨髓瘤等，多數可以通過自體造血幹細胞移植來控制病情，但也有一部分需要進行異基因造血幹細胞移植；

5、系統性紅斑狼瘡：部分非血液系統的疾病，比如系統性紅斑狼瘡等，當藥物治療無效的時候，也可以考慮異基因造血幹細胞移植治療。