神經病理性疼痛可能每一個截癱患者都會遇到，患者常在夜深人靜的時候疼痛加劇，使其更加煩躁，所以對於截癱以後的神經病理性疼痛治療主要包括：

1、藥物治療：主要用抗癲癇藥物，比如卡馬西平、奧卡西平、普瑞巴林、丙戊酸、苯妥英、妥泰。對於病程較久，長期慢性截肢後的疼痛，按指南要首選三環類抗抑鬱藥物，比如阿米替林或者異丙嗪、5-羥色胺再攝取抑制劑，如帕羅西汀；

2、心理治療：患者有時合併有抑鬱、焦慮、睡眠障礙，可以給抗焦慮、抗抑鬱藥物；

3、物理治療：包括物理因子治療、理療、磁療、超短波治療、超聲波治療，包括重複經顱磁刺激的治療，也是較好的治療方法。