治療植物神經紊亂的方法沒有最好，只有努力配合醫師治療，才能收到好的臨床效果。植物神經紊亂的診斷是在器質性病變被排除以後，是皮層下植物神經調節功能紊亂，調節較差，患者可出現憋氣、心慌、氣短、出汗或者無汗，或者消化道症狀。凡是植物神經支配的臟器出現功能紊亂，才叫植物神經紊亂，要排除器質性病變之後，才能確診。一定要在專業醫師確診之後，明確患者為植物神經紊亂。

植物神經功能紊亂並不可怕，可以自愈，可以在治療好器質性病變之後，隨之改善。單純的治療植物神經紊亂，所謂的自愈或者自我治療，效果並不理想。一定要在醫師指導之下進行治療，包括物理、化學、體育鍛煉、文體活動、增加抵抗力等綜合措施才能達到臨床效果。