腦神經痛多指顱神經疼痛，包括三叉神經、舌咽神經痛。三叉神經痛主要表現為面部眼支、上頜支、下頜支，某一分佈範圍出現短暫、快速刀割或電擊樣劇烈疼痛。疼痛通過扳機點觸發且病因較多，如果是舌咽神經痛通常出現咽後壁、外耳道吞嚥疼痛。

如果腦神經痛指腦部神經及枕大神經痛，則易發生腦部神經痛，分佈於耳後部位，可出現經典神經痛症狀，如表現為短暫、劇烈疼痛感。疼痛根據不同情況有不同原因，部分與勞累，受涼、病毒感染有關。三叉神經痛多由於血管擴張、壓迫導致。