繼發性癲癇如果經嘗試，使用多種藥物治療均無法控制發作，且通過神經內科醫生評估，患者可選擇手術干預治療。但是手術之前，需要明確患者發病原因，對於腦腫瘤、血管瘤原因引起的癲癇，則必須通過手術治療；由於腦炎、腦出血、外傷等引起的繼發性癲癇，手術治療則相對困難，效果不理想，需要經過綜合評估才能決定；對於發作次數不多，但是傷害性較大，嚴重影響患者生活質量的繼發性癲癇亦可選擇手術干預。