白塞病可以控制，但不能夠完全治好（治癒或除根）。由於發病機制和病因不明，目前白塞病發生以後尚沒有根治的辦法，但可以通過治療來緩解相應的症狀，控制病情的發展。當存在輕度的眼部疾病的時候，需要用一些眼部的眼膏或者滴眼液來緩解眼部的症狀，嚴重的眼病需要激素及免疫抑制劑治療。口腔潰瘍發生以後，可以用糖皮質激素軟膏、冰硼散、錫類散以及其它治療口腔潰瘍的藥物來進行治療。

生殖器發生潰瘍以後，也需要用1:5000的高錳酸鉀溶液清洗，外用抗生素的軟膏。發生白塞病需要在急性期來進行支持、對症療法。目前白塞病的全身治療，包括糖皮質激素的使用以及免疫抑制劑的使用，需要在醫生的嚴格監測下進行。白塞病一般預後良好，多數情況下，不會危及患者的生命，少數患者可能發生比較嚴重的併發症，預後不佳。"