肺栓塞的治療一般是3個月，但是不同原因，治療時間不一樣。肺栓塞經常分為原發性和繼發性，原發性找不到原因，有些可能是基因突變，也有可能是凝血功能異常，這類患者可能需終身服藥，進行抗凝治療。如果能找到原因，臨床多屬於感染引起。不同疾病治療時長不一樣，如果是腫瘤引起的肺栓塞，除了抗腫瘤治療外，至少需服用抗凝藥6個月。

如果是其它疾病形成，比如長期臥床形成下肢深靜脈血栓引起，常規是3個月，3個月後看上述誘因或者原因是否得到解除，如果不能解除，仍需長期臥床，可以再加機械性預防措施，比如彈力襪等辦法預防下肢血栓形成，因為下肢血栓形成是肺栓塞的主要因素之一。