高危肺栓塞患者，血流動力學不穩定，出現低血壓休克，需要採取溶栓治療，並非每個肺栓塞患者都可以溶栓治療。

對於有顱腦外傷，或者近一個月內有活動性出血的患者，不建議溶栓治療，可以介入下局部溶栓治療。

溶栓常用的藥物包括尿激酶、鏈激酶、阿替普酶。國外肺栓塞指南中，阿替普酶建議用量為100mg，但在我國新的指南中，阿替普酶推薦使用量為50mg。