慢性心肌炎是比較嚴重的疾病，由急性心肌炎沒有治癒發展而來。慢性心肌炎是慢性病，其無法治癒。隨著病情進展，逐漸可以引起心臟擴大、心肌收縮力下降，出現各種心律失常，有時還會引起血栓栓塞，甚至引起患者猝死，慢性心肌炎逐漸發展最後進展為擴張型心肌病。

對於慢性心肌炎的患者要長期給予ACEI、ARB以及β受體拮抗劑等藥物，以減輕心肌重構，延緩病變進展，改善患者預後。對於出現心力衰竭的患者要給予利尿劑減輕心臟負荷，必要時還要使用洋地黃製劑增強心肌收縮力，以改善心衰症狀。