急性上呼吸道感染的常見病原體如下：

1、病毒：包括鼻病毒、EB病毒、皰疹病毒、柯薩奇病毒、呼吸道合胞病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、流感病毒、副流感病毒等。上述病毒可以引起病毒性鼻咽炎、急性喉炎、急性咽峽炎及皰疹性咽峽炎，當病毒感染3-4天后，細菌可能會侵入呼吸道而合併細菌感染；

2、細菌：比如鏈球菌，感染後可以引起急性扁桃體炎、化膿性扁桃體炎、細菌性扁桃體炎。當合並細菌感染時，患者會表現為高熱、咳嗽、有痰，檢查血常規會發現白細胞及中性粒細胞增高。若患者出現雙側扁桃體增大的症狀，可以加用抗生素進行治療；

3、非典型病原體：包括支原體及衣原體。