引起急性上呼吸道感染的因素有多種，主要包括細菌感染和病毒感染，其中細菌性的上呼吸道感染亦可初始為細菌感染或可繼發於病毒感染。具體分類說明如下：

1、細菌感染：20％-30％的急性上呼吸道感染由細菌感染引起，常見為溶血性鏈球菌、肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌、葡萄球菌，革蘭氏陰性桿菌較為少見。較為常見的溶血性鏈球為口腔定植菌，可導致急性咽扁桃體炎等疾病，可應用抗生素進行治療；

2、病毒感染：上呼吸道感染70％-80%由於病毒感染所引起，不需應用抗病毒或抗生素進行治療。