亞急性感染性心內膜炎在血培養的時候每次抽10ml的血，需要注意的是一定要嚴格的無菌操作，防止血液標本被汙染，動脈或者靜脈的血都可以，而且應該每隔1個小時連續採血不少於3次，隨後進行血培養，至少2次培養出同樣的微生物才可以明確診斷，但是不一定在發燒或者寒戰的時候採血，要同時進行厭氧和需氧培養。

如果考慮是真菌或者立克次體感染應該做特殊培養，如果是應用抗生素之後的病人需要停藥數天或者1周後再採血，培養之後的結果要觀察不少於3周，如果是布氏桿菌則不少於4-6周。