外科口罩和普通醫用口罩有一定區別，外科口罩的防水性能普遍高於普通醫用防護口罩，可防止在手術中的血液或實驗中的液體、氣液、噴射物噴濺對醫生造成感染或對實驗人員造成感染等。外科口罩對病毒的防護能力也相對較強，可以用於預防流感、呼吸道系統等疾病傳播，還可以避免患者將病毒傳給其他人。

而普通醫用口罩防水性與顆粒過濾效果要求較低，即醫用口罩比外科口罩要求低，防護性能要差。所以大家購買時或使用時需要認準標記，一定要儘量使用醫用外科口罩進行防護。