支氣管結核若早發現、早期合理治療，大部分不會遺留明顯後遺症，或僅遺留輕微咳嗽、咳痰、活動後氣促等不適。如採取抗結核藥物治療方案及局部支氣管鏡治療方案不合理或治療不及時，易併發支氣管擴張症、肺不張、支氣管哮喘、肺部感染，嚴重影響患者生活及生存質量。早期病情未得到有效控制，繼續進展可出現呼吸衰竭導致死亡。

支氣管結核早期診斷較難，臨床發現部分患者確診支氣管結核時已經形成肺不張，甚至肺毀損。一旦懷疑或確診為支氣管結核，建議儘早前往專業結核病醫院就診，採取積極綜合治療方案，遵醫囑用藥治療。