支氣管結核典型臨床表現為刺激性咳嗽、咳痰、咯血及呼吸困難等，合併感染時可出現咳大量黃痰。氣管及中心氣道狹窄時，咳嗽聲如犬吠。支氣管結核病變導致支氣管黏膜充血、擴張，血管通透性增高及血管壁破壞可導致咯血，多為痰中帶血，偶見中量咯血甚至大咯血。氣道黏膜充血、水腫、肥厚、肉芽增殖及疤痕狹窄、炎症、氣道分泌物增多，可發生喘鳴、呼吸困難。

支氣管結核病情嚴重形成支氣管淋巴瘻時，大量淋巴結乾酪壞死物破潰進入支氣管內，可造成肺不張，甚至出現窒息危及生命。部分患者伴發熱、盜汗、消瘦、月經不調等全身症狀及變態反應性關節炎、結膜炎，少部分患者症狀輕微或無任何不適。