肺部的麴黴菌感染有幾種不同形式，最嚴重的是引起肺呼吸功能嚴重受損引起呼吸衰竭，比如侵襲性肺麴黴菌病。還有其他不同方式，包括麴黴菌會引起空洞，即麴黴球所致。

有些麴黴菌性感染在支氣管或者氣管，還會引起過敏性反應。有些患者對麴黴菌的成分出現過敏反應後可能出現類似於哮喘樣的症狀，出現喘息、氣急、呼吸困難。除了抗麴黴菌治療之外還要使用抗哮喘類的藥物，才能使疾病得到改善。所以肺部曲黴菌感染有很多種形式，採取的治療手段措施可能也會有所不同。