因為甲亢患者服藥3個月，可能功能好轉，症狀可能明顯緩解，但是並不意味著已經治好，此時停藥可能會造成甲亢病情反覆。甲亢的藥物治療是足量階段，這時抗甲狀腺藥物劑量較大，隨著給藥，患者症狀逐漸緩解，通常用藥3周左右，患者的高代謝症候群逐漸緩解。在用藥2-3個月後，患者的臨床症狀基本控制。這時複查甲狀腺功能，也可以看到甲狀腺功能明顯改善，甚至部分患者可能甲狀腺功能逐漸恢復至正常狀態，可能就自認為病情已經控制或治好，不再就診或自行停藥。

自行停藥後甲亢症狀再次出現，甲狀腺功能指標再次升高，需要再次從頭開始治療，這主要和甲狀腺治療藥物的特點有關。因為甲亢治療除症狀緩解、指標改善外，還涉及長期藥物治療療程。抗甲狀腺藥物療程通常在1.5-2年，3個月雖然能改善症狀、控制甲狀腺指標，但是甲狀腺是一種自身免疫性疾病，整體的免疫狀態和抗體滴度仍然偏高。所以在用藥前一定要做好長期用藥的準備，遵照醫生的囑託，不能自行停藥。