新生兒甲減大部分能治癒，新生兒甲減分暫時性甲減與永久性甲減兩大部分：

1、暫時性甲減：是短期內進行藥物替代治療，兒童服藥一段時間後藥物慢慢減量或停藥，停藥後自身甲狀腺素分泌足夠，這種情況不需要藥物替代，自然會治癒；

2、永久性甲減：見於各種原因，如先天性甲狀腺發育不良、甲狀腺沒有正常結構，兒童甲狀腺手術、外傷，基因問題導致自身無法合成甲狀腺素。需要終身甲狀腺激素替代治療，如果甲狀腺激素替代治療非常標準，要定期隨訪，替代治療檢測在正常範圍，認為疾病得到控制或穩定。