甲狀腺炎通常不會影響核酸檢測。核酸檢測是明確患者是否出現新型冠狀病毒，而甲狀腺炎無論是亞急性甲狀腺炎，還是橋本甲狀腺炎，都不會出現核酸檢測陽性的情況，所以甲狀腺炎不會影響核酸檢測。因為亞急性甲狀腺炎的患者主要症狀是發熱、頸部疼痛，所以一旦出現發熱，應當先去發熱門診檢查進行核酸檢測，核酸檢測除外新型冠狀病毒肺炎後，才應當至內分泌門診進一步檢查，明確是否出現亞急性的甲狀腺炎。

亞急性甲狀腺炎是自限性疾病，過一段時間患者的發熱和頸部疼痛的症狀，可以得到逐步緩解。當然如果亞急性甲狀腺炎患者如果在發熱狀態下，不應當注射新型冠狀病疫苗，應當等病情緩解、穩定以後再注射新型冠狀病毒疫苗。