生長激素缺乏的原因可有原發性和繼發性，具體如下：

1、遺傳原因：多數為常染色體隱性遺傳，少數為常染色體顯性或伴性遺傳。故該生長激素缺乏症多見於小兒，如發現小兒有不生長、不發育的情況，應考慮是否存在遺傳性疾病；

2、特發性生長激素缺乏症：發病原因尚未完全明確，小兒在出生前後的圍生期，可能有難產、早產、嚴重窒息、發乾或抽搐等情況；

3、繼發性生長激素缺乏症：患有垂體瘤、顱咽管瘤、神經纖維瘤，壓迫到下丘腦和垂體；或暗區有放射性治療史，有顱內感染或者肉芽腫性病變，都可引起生長激素的缺乏；

4、生長激素不敏感綜合徵：生長激素分泌足夠，但是靶器官對生長激素不敏感而引起矮小症，是一種遺傳性疾病。