馬蹄腎是腎的先天發育畸形，每個人會有兩個腎，左邊一個，右邊一個，這兩個腎下邊稱為下極，兩個腎連在一起時稱為馬蹄腎，形似馬蹄。在CT水平橫斷面一層一層來掃，首先看到是兩個腎的上極、中極分別在腹部的兩側，到下極可以看到中部合併在一起，這是常見表現。

中醫有時候可能會容易漏診，懷疑馬蹄腎最好再做CT三維重建。CT三維重建可以沿著任意的斷面進行切，可以沿著CT冠狀面，冠狀面可以同時看到兩個腎及下極是否聯合在一起，如果連在一起就是馬蹄腎。