中醫治療萎縮性胃炎，需要辨證治療，有肝胃氣滯證、肝胃鬱熱證、脾胃溼熱證、脾胃虛弱證（含脾胃虛寒證）、胃陰不足證、胃絡瘀阻證等不同的類型，建議在中醫大夫指導下用藥。

中成藥可考慮摩羅丹、養胃舒膠囊、氣滯胃痛顆粒、胃蘇顆粒、保和丸、香砂六君丸、香砂養胃丸、陰虛胃痛沖劑等。脾陽虛、怕冷，可給予乾薑、高良薑、砂仁、肉桂等食療，有溫胃散寒的功效。