幼年風溼關節炎的治療主要包括在急性期的誘導緩解治療和慢性期的維持治療。急性期的治療首先要注意休息、加強營養，藥物治療方面可以選用非甾體抗炎藥，如布洛芬，還可以選擇慢作用抗風溼藥，如甲氨蝶呤、柳氮磺吡啶。這類藥物通常起效比較慢，常常需要數個月甚至半年的時間才能起效。部分病情進展的患者需要選擇小劑量糖皮質激素。然而糖皮質激素對於幼年患者影響比較大，需要慎重選用，嚴格控制劑量。目前可替代的藥物有生物製劑，最經典的生物製劑是腫瘤壞死因子拮抗劑以及白介素-6拮抗劑。急性期疾病得到緩解以後，進入慢性期維持治療，儘量停用激素，以小劑量慢作用抗風溼藥，以及必要時適當的生物製劑維持疾病長期穩定。

因此幼年風溼性關節炎需要在醫生的判斷指導下，綜合評估病情，根據不同情況選擇用藥，從而才能減少疾病的復發以及減少藥物的副作用，保證生長發育。