ANCA相關性血管炎導致的腎病，現在治療效果大多數較好。ANCA相關性血管炎可能較輕的患者只有鏡下血尿，嚴重可能存在大量血尿以及蛋白尿，更嚴重的患者有心源體腎炎形成，影響腎功能。如果治療不及時，可能會導致慢性腎功能不全。

ANCA相關性血管炎導致腎臟病預後，取決於病情進展情況以及開始治療時病情嚴重程度。對於只有血尿或者只有少量蛋白尿患者，只要使用常規劑量激素和免疫抑制劑就能控制疾病發展。但是ANCA相關性小血管炎導致的腎病，經常會出現心源體腎炎以及影響到腎功能情況，需要激素衝擊，甚至血漿置換治療。

有時病情不容易控制，還需進行兩次，甚至三次激素衝擊，大多數可以使腎功能得到逆轉，大部分患者腎功能可以維持在較正常水平。即使腎功能不能完全逆轉，一部分患者進入慢性腎功能不全狀態，可能需要透析，目前透析水平和質量較高，基本不會影響壽命。