大部分先天性心臟病的患兒無明顯症狀，因為病情相對輕微，對患兒的生長發育一般不會有明顯影響。如果先天性心臟病比較嚴重，可出現下列症狀：
1、左向右分流型先天性心臟病：容易出現反覆上呼吸道感染、肺部感染、肺炎，嚴重者甚至需要反覆住院，影響患兒的生長發育；生長發育相對比較差，因為患兒的食慾、活動能力比正常寶寶差；吃奶沒勁、餵養困難或者拒食，吃奶時出現嗆咳、呼吸急促；
2、右向左分流型先天性心臟病：發現較早，患兒的生長發育更差，出生時即可能出現口唇、指甲青紫，或者哭吵時口唇嚴重青紫，甚至於缺氧發作，需要緊急治療。患兒長大後喜蹲踞，表現為活動能力下降，走一段路以後缺氧明顯，需要蹲下來。
對於先天性心臟病的患兒，要及早診斷，必要時儘早進行手術治療。