免疫缺陷病發病原因主要包括以下兩大類：

1、原發性：又稱先天性免疫缺陷病，根據累及免疫細胞不同，可分為抗體缺陷為主的免疫缺陷病、原發性T細胞免疫缺陷病、聯合免疫缺陷病、吞噬細胞免疫缺陷病以及補體免疫缺陷病；

2、繼發性：又稱後天性免疫缺陷病，主要由於自身因素導致，如腫瘤或自身免疫病需要長期應用免疫抑制劑時易繼發感染，最主要為HIV病毒感染。

免疫缺陷病無論為原發或繼發，臨床特點主要存在合併感染，可合併自身免疫病。臨床需充分認識此類疾病，甚至需通過基因檢測明確是否存在免疫缺陷病。