解脲支原體感染的常用治療方式是抗菌素治療，常用抗菌素主要有大環內酯類抗菌素，比如阿奇黴素、羅紅黴素或者紅黴素，其他少見抗菌素，如米諾環素等。上述抗菌素對支原體的感染比較敏感，用藥效果較好。

但少數支原體會對其中一類或部分藥物耐藥，需要針對支原體進行培養或進行藥物細菌敏感性試驗。根據藥敏試驗的結果選擇敏感抗菌素治療，明確何類大環內酯類抗菌素或者具體何種藥物，對解脲支原體有效，然後再選擇敏感抗菌素。