支原體感染所引起咳嗽和其他致病微生物所誘發咳嗽，在症狀上沒有太多差異。一般支原體感染所引發咳嗽程度不會特別劇烈，伴有少量到中等量咳痰，尤其以白色黏痰為主，一般不會伴有膿性漿液性痰，有時也能見到稀薄痰，即輕度到中度咳嗽，伴有少量咳痰。最主要診斷還要根據臨床化驗，通常是驗血或者做支原體培養方法，驗證是否感染肺炎支原體。如果是肺炎支原體感染，要針對肺炎支原體對症治療。

總之，肺炎支原體所引發咳嗽沒有病原特異性，很難單純從某些症狀特點推斷是否為支原體感染。對於咳嗽的鑑別診斷，通常還要根據病原、實驗室診斷結果綜合診斷。