大部分敗血症可以痊癒，兒童敗血症屬於血液系統疾病，由細菌感染引起細菌在血液中繁殖，是否會痊癒，主要與孩子的免疫力、及時治療與否、是否使用強力抗菌素治療、細菌對藥物是否敏感以及治療時間是否足夠長等有關。如果患兒處於新生兒階段，此時免疫力相對比較低，半原發性病灶，如肺炎、腦膜炎，此時敗血症治療相對較困難。如選擇合適的抗菌素，治療療程足夠長，大部分孩子可以痊癒。但是有血液系統疾病，使用化療藥的患兒，或存在免疫缺陷綜合徵，如艾滋病患兒，敗血症較難治療。部分孩子出現反覆血液系統感染，可能威脅生命。

總體來講，敗血症對於免疫力正常的孩子，如果抗菌素使用得當，及時得到治療，大部分患兒能夠痊癒。但是有免疫缺陷或存在原發基礎疾病，使用免疫抑制劑的部分患兒不易痊癒，可能出現生命危險。