新生兒敗血症是嚴重的疾病，多久能治好取決於嚴重程度。對於一般的新生兒敗血症，尤其是細菌培養沒有培養出來細菌，稱為培養陰性的新生兒敗血症。至少要治療2周的時間，給予抗生素靜脈應用。如果細菌培養陽性，可能需要延長時間，延長到3周。還要看新生兒敗血症有沒有併發症，如果合併腦炎，做腦脊液檢查發現有細菌，必須至少抗感染治療4周。如果新生兒敗血症發生骨髓炎，則靜脈抗生素應用時間不能少於6周。因此新生兒敗血症多久能夠治好，取決於疾病的嚴重程度，取決於臟器損害的程度，有無併發症。

細菌培養陰性的敗血症通常應用2周抗生素，血象、體溫、精神狀態、食慾好轉。如果合併腦膜炎或者培養有細菌，可能時間要延長恢復時間，有腦膜炎的患兒至少4周，有骨髓炎的患兒至少6周，其他併發症可能恢復時間更長。新生兒敗血症是嚴重疾病，必須徹底治癒，否則容易遺留後遺症。