敗血症和菌血症的區別是敗血症病情嚴重程度重些，菌血症病情程度相對要輕。敗血症的概念在過去用的較多，現在多數用膿毒血癥代替敗血症。膿毒血癥一般在血裡可以檢測培養到細菌，還能檢測到它出現器官功能的改變，比如肝腎功能的損害，出現全血細胞減少，甚至出現血壓下降。

菌血症可以分為一過性的菌血症或血流感染的菌血症，它在血裡培養細菌，沒有發生器官功能的損害和感染性休克。它跟膿毒血癥相比，膿毒血癥或敗血症病情更重些，菌血症病情程度相對要輕。但菌血症要找到病因，是什麼原因發生的菌血症，要把源頭找到才能進行有效治療。