唾液腺囊腫有惡變的可能。唾液腺囊腫包括唾液腺黏液囊腫和腮腺囊腫。腮腺囊腫分為瀦留性和先天性，瀦留性腮腺囊腫和瀦留性黏液囊腫的病因和病理相似，亦為良性病變；先天性腮腺囊腫包括皮樣囊腫、鰓裂囊腫和先天性腮腺導管囊狀擴張，多屬於良性病變，但鰓裂囊腫具有癌變的可能。

唾液腺黏液囊腫又包括小唾液腺黏液囊腫和舌下腺囊腫，而依據病因則可分為外滲性和瀦留性，外滲性較為多見，約佔80%，由導管破裂，唾液流於組織間隙所形成黏液性肉芽腫或充滿黏液的假囊，無上皮襯裡，屬於良性病變；瀦留性較為少見，約佔20%，由導管部分阻塞，分泌唾液瀦留，導管囊性擴張所致，組織學表現為具有上皮襯裡，瀦留的黏液團塊和結締組織被膜三種結構，同樣為良性病變。