痰中發現結核分枝桿菌通常見於肺結核，淋巴結結核患者痰中找到結核分枝桿菌通常較少見，主要明確淋巴結結核發生部位以及有無合併肺結核。

單純淋巴結結核患者，例如頸淋巴結核、縱隔淋巴結、腹腔淋巴結結核患者痰液中通常無結核桿菌，但淋巴結穿刺液或淋巴結破潰流出膿液中常可以查到分枝桿菌。如果合併肺結核或氣管、支氣管周圍淋巴結結核，破潰進入氣管、支氣管可以在患者痰液中找到結核桿菌。