輪狀病毒感染的治療較容易，主要是防止腹瀉導致嚴重併發症。輪狀病毒感染可引起秋季腹瀉，屬於兒童腹瀉的主要原因，治療並非根除病毒感染，而是通過休息、清淡飲食，部分患者有自愈傾向。

嚴重患者主要給予營養支持，如果患兒不能較好進食，可適當補水、補充電解質，防止脫水引起電解質紊亂。如果腹瀉較嚴重，可予以相應止瀉藥物如蒙脫石散，能夠幫助控制症狀。此外，益生菌的應用，如雙歧桿菌、地衣芽孢桿菌等，對於改善症狀也有幫助。