泌尿系統反覆感染多數是因為治療不徹底，以及細菌或其他病原體毒力過強，也存在泌尿系統梗阻等原因。泌尿系統感染主要是細菌或非細菌性病原體感染，如大腸埃希菌、鏈球菌、金黃色葡萄球菌、支原體、衣原體等，從尿道口進入尿道、膀胱等部位，形成局部的菌落堆積。部分甚至通過輸尿管上行至腎臟腎盂，而產生急性的腎盂腎炎，或慢性泌尿系統感染。

通常需使用廣譜、藥敏試驗敏感的藥物進行相應處理，且需足劑量、足療程使用。通常包括頭孢二代、頭孢三代，以及喹諾酮類等藥物，連續治療1-2周，在複查尿常規或尿培養後，確定沒有明確感染徵象時即可停藥。另外局部衛生不潔、飲水量過少、不潔的性生活等，也可能造成泌尿系統感染反覆發作。對於毒力較強的細菌，使用廣譜抗生素可能效果欠佳，所以需使用藥敏試驗的相關藥物，進行足劑量、足療程治療。