正常情況下，黴菌不會導致HPV感染，即人乳頭狀瘤病毒感染。黴菌目前也稱為外陰陰道的假絲酵母菌，為一類由於下生殖道菌群失調，而引起的生殖道感染。黴菌通常會引起陰道的分泌物增多、外陰瘙癢等，嚴重時可造成陰道黏膜脫落，形成淺表性潰瘍。但通常真菌感染時，不會導致HPV感染，兩者是獨立的感染類型。

目前認為HPV感染是一類性傳播性疾病，可以引起宮頸病變，如宮頸的癌前病變或宮頸癌。黴菌通常只侷限於陰道黏膜，導致瘙癢和陰道分泌物增多。如果兩種疾病同時存在，通常考慮優先治療黴菌，給予恰當的藥物。同時對於HPV感染進行監測，通過細胞學檢測，聯合HPV感染，判斷是否需要進行宮頸陰道鏡檢查和活檢。