黃連素指小檗鹼，即黃連內部提取出的主要成分。該藥具有清熱解毒、瀉火燥溼的作用，主要用於治療腸道感染。胃腸炎的患者應用黃連素的效果較為理想，但非感染造成的痢疾、脾胃虛寒腹瀉者不可使用。

該藥主要用於治療溼熱毒邪造成的痢疾甚至黃疸，並且對於出現發熱，尿黃，目赤，牙齦腫痛，膿血便等症狀的患者而言，應用黃連素的效果較好。但是並無上述症狀時不可輕易使用黃連素止瀉，需要明確腹瀉的原因。