孩子發燒、頭疼不一定是腦炎。因為發燒時常常會引起頭疼，會出現腦炎的一些表現。因為腦炎孩子會有頭痛、意識模糊、肌張力改變及精神上的譫妄等表現，但並不是發燒、頭疼就要考慮腦炎。若一般情況良好，腦炎可能性較小。

年齡較小的兒童和大一點的兒童要給予區別，兒童除非是反覆高燒不退，才要考慮是腦炎。若是嬰兒出現發燒，要常規進行腰穿，檢測腦脊液，評判是否為腦炎。年齡較大的孩子腦屏障功能已經發育完善，並不容易出現腦炎，要根據其它臨床表現綜合評估，比如有無煩躁、嘔吐、哭鬧不安等表現。通常情況下發燒、頭痛，並不是馬上想到腦炎，主要以單純的呼吸道感染或者消化道感染多見。