在臨床上絕大多數膽囊息肉危害不大，極少數情況下膽囊息肉有可能會造成嚴重後果。膽囊息肉在臨床上根據息肉的成分，分為真性息肉和假性息肉，絕大多數病變屬於假性息肉，也就是膽汁酸與膽固醇溶解失平衡所形成的膽固醇單水結晶。絕大多數無明顯臨床症狀，是在體檢中無意發現。

少數膽囊真性息肉，也就是膽囊黏膜增生，如果是寬基底型，直徑超過1cm以上，有可能會引起惡變。目前在臨床上對於膽囊癌，如果病變為Ⅲ期以上，通常治癒率總體比較低，預後比較差。另外，比較微小的膽囊息肉有可能在排出息肉時出現膽源性胰腺炎。