腹腔囊腫有較多種，來源於腸繫膜的比較常見，稱腸繫膜淋巴管瘤，與腸道關係較密切。當囊腫扭轉時會附帶腸管發生扭轉，如果出現這種情況，提示病情較嚴重。腸扭轉後如果沒有及時發現，患兒會出現便血，甚至休克等。如果處理不及時，扭轉的腸管會壞死。壞死的腸管範圍過大，可能影響患兒以後的生長發育，甚至會因為出現短腸而導致患兒無法存活。

大網膜囊腫等囊腫與腸道關係不大，只要不出現感染，不形成腹腔膿腫，危害相對不較大。臨床比較少見的腹腔囊腫有卵巢囊腫，一旦與附著的器官形成扭轉，也比較嚴重，要及時到醫院就診。如果不及時處理，甚至會造成卵巢壞死。