膽結石掉入膽總管形成膽總管結石，可通過微創手術進行治療。膽囊結石合併膽總管結石，屬於膽結石較常見的併發症。結石經由膽囊管掉入膽總管引起膽道梗阻，可在腹腔鏡下進行膽囊切除，聯合膽管切開取石方法，通過膽道鏡及特殊取石器械將結石取出。膽管切開處可一期縫合或留置T型管，根據膽管結石大小、數量、膽管炎症以及膽管下段是否通暢決定。
老年患者或複發性膽管結石，可通過ERCP及內鏡下經由膽總管下段將結石取出，同時聯合膽囊切除術。兩種治療方法對於不同的膽總管結石患者而言，應根據年齡、結石大小、膽管直徑及患者身體狀況考慮，通常均可選擇。膽管結石一經確診，建議儘早通過外科或內鏡方法進行治療。