膽結石可以導致穀草轉氨酶與谷丙轉氨酶升高。膽結石可位於肝內或肝外膽管中，正常人每天會分泌1000-1200mL膽汁，隨膽管流入十二指腸。當結石發展到一定程度會導致膽管阻塞，膽汁無法有效流入十二指腸，淤積在肝內或肝內膽管而導致膽管擴張，造成膽汁中的細菌增生、繁殖並引發膽管炎。

此外，膽汁也可以由於膽結石引起的梗阻反流到血液中，引起皮膚、鞏膜的黃疸。上述情況均可導致炎症的發生，從而繼發肝臟功能的損害，在血清學中表現為轉氨酶改變，如穀草丙氨酶持續升高。而及時、有效地通過手術切除膽結石，則是治療轉氨酶升高的較好方法。