鑑於腦血栓具有複發性和致殘、致死性，所以一旦確診為腦血栓，無論病情輕重都需要長期服用抗栓藥物，以防腦血栓的再發。

血栓的根本原因是腦動脈已經發生了不可逆的病變，醫學上可以對腦血栓的症狀進行治療，但病因卻難以去除。只能通過長期服用阿司匹林和他汀類藥物，使血管內的斑塊不再增長，並減少其脫落的可能性，維持血流的穩定，維持患者的症狀穩定，都是通過長期服用抗栓藥物得以實現的，所以即使是輕微的腦血栓，也需要長期服藥治療。