小腦血栓如果梗塞灶較小，早期能夠及時正確的治療，可以治好。如果梗塞灶較大，可能會留有一定的後遺症。

小腦血栓患者主要表現為頭暈、噁心、嘔吐，也可以出現平衡障礙和共濟失調，有些患者可以出現爆發性的語言。多數患者無肢體感覺障礙，或者是運動功能障礙。超早期適合溶栓時，可以進行靜脈溶栓治療，一般應用阿替普酶或者是尿激酶。

不適合溶栓時，主要是儘早口服阿司匹林抗血小板聚集藥物，同時應用改善血液循環的藥物，以及保護神經的藥物。保護神經的藥物一般應用依達拉奉、胞二磷膽鹼、腦蛋白水解物、奧拉西坦、吡拉西坦。同時可以應用丁苯肽，改善神經功能缺損的症狀和體徵。病情穩定後，可以進行平衡訓練以及針灸治療。