肝外膽管結石應用藥物無法排出，最好的方式是手術治療。膽總管堵塞會併發感染，出現高熱、疼痛以及黃疸等症狀。膽管內結石無法順利排入腸道，繼續阻塞膽管將會導致膽管炎性感染，同時膽管內壓力非常高，膽道內細菌會逆行擴散，甚至致病菌和毒素通過肝竇到達肝靜脈中，逆行進入循環，容易引起全身中毒症狀，如寒戰、高熱。膽道被結石完全堵塞，可以引起急性化膿性膽管炎，這是一種非常危險的疾病，如果治療不及時短期內會導致死亡。

膽汁無法流入腸道，梗阻1-2天會出現黃疸、尿色變黃、便色逐漸發白如陶土樣。梗阻長期不治癒會帶來淤積性膽汁肝病變，最終出現門脈高壓。泥沙樣結石較容易排出，但是一般結石無法排出，與結石性質、形狀、患者膽道功能有關。